MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Gluconacetobacter xylinus NBRC 3288 plasmid pGXY020

Total Repeats: 291

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016021	CAC	2	6	978	983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_016021	CAC	2	6	1023	1028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_016021	CGGTG	2	10	1055	1064	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_016021	CAC	2	6	1162	1167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_016021	CCA	2	6	1188	1193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_016021	A	6	6	1246	1251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016021	CAC	2	6	1290	1295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_016021	CAC	2	6	1338	1343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_016021	C	6	6	1343	1348	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10	NC_016021	ATAA	2	8	1369	1376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016021	T	8	8	1528	1535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016021	CGGCG	2	10	1568	1577	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_016021	AGG	2	6	1592	1597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016021	GAA	2	6	1602	1607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016021	GA	3	6	1618	1623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016021	TCT	2	6	1788	1793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016021	AGC	2	6	1814	1819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016021	T	6	6	1863	1868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016021	CCA	2	6	1916	1921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_016021	AAT	2	6	2017	2022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016021	CAG	2	6	2122	2127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016021	GGGC	2	8	2134	2141	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_016021	GGT	2	6	2260	2265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016021	TAA	2	6	2270	2275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016021	G	6	6	2286	2291	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016021	ATTT	2	8	2933	2940	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016021	A	7	7	2978	2984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016021	TCG	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016021	TCA	2	6	3122	3127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016021	T	7	7	3154	3160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016021	GAA	2	6	4844	4849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016021	GCA	2	6	4865	4870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016021	GAT	2	6	4927	4932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016021	CTT	2	6	4949	4954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016021	GA	3	6	5017	5022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016021	GTTTT	2	10	5045	5054	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016021	GGGGC	2	10	5091	5100	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
38	NC_016021	GAGG	2	8	7531	7538	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016021	TTG	2	6	8261	8266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016021	GTG	2	6	8291	8296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016021	CAGC	2	8	8470	8477	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016021	GAC	2	6	8482	8487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016021	TTA	2	6	8502	8507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016021	TCC	2	6	8559	8564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_016021	GCC	2	6	8569	8574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_016021	GCA	2	6	8584	8589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016021	CAA	2	6	8610	8615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016021	TAAGT	2	10	9604	9613	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016021	CT	3	6	9677	9682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016021	AGG	2	6	15638	15643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016021	A	7	7	16246	16252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016021	ACAGTA	2	12	16258	16269	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_016021	CGG	2	6	16281	16286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016021	TCTGA	2	10	16308	16317	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_016021	GCA	2	6	16318	16323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016021	AT	3	6	16386	16391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016021	CT	3	6	20290	20295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016021	CGAC	2	8	20299	20306	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016021	TAA	2	6	20382	20387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016021	TTAA	2	8	20448	20455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016021	GAT	2	6	20508	20513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016021	GCT	2	6	20532	20537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016021	T	6	6	20546	20551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016021	A	6	6	20591	20596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016021	ACGA	2	8	20625	20632	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_016021	TCT	2	6	20687	20692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016021	TCG	2	6	20723	20728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016021	GTG	2	6	20731	20736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016021	GGC	2	6	20764	20769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016021	GCTG	2	8	20842	20849	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_016021	TAT	2	6	21029	21034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016021	GAT	2	6	21046	21051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016021	CAT	2	6	21128	21133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016021	CTG	2	6	21295	21300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016021	TCC	2	6	22350	22355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_016021	CAT	2	6	22374	22379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016021	GC	3	6	22471	22476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016021	GAC	2	6	22491	22496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016021	AGCTC	2	10	22553	22562	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_016021	GAGC	2	8	22563	22570	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016021	TG	3	6	22600	22605	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016021	CGG	2	6	22628	22633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016021	CGC	2	6	22694	22699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_016021	GCG	2	6	22748	22753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016021	CAC	2	6	23865	23870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_016021	C	6	6	23919	23924	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
87	NC_016021	GAG	2	6	23971	23976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016021	CCAGC	2	10	24252	24261	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
89	NC_016021	CAT	2	6	24291	24296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016021	GGT	2	6	24308	24313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016021	CCGT	2	8	24315	24322	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_016021	TTG	2	6	24359	24364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016021	GAT	2	6	25575	25580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016021	ACC	2	6	25609	25614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_016021	GGC	2	6	25684	25689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016021	TCT	2	6	25711	25716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_016021	G	6	6	26414	26419	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016021	GCA	2	6	26508	26513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016021	GAGAT	2	10	26569	26578	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016021	GCG	2	6	28523	28528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016021	A	6	6	28557	28562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016021	TG	3	6	28602	28607	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016021	TCA	2	6	28648	28653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016021	CCAG	2	8	28663	28670	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_016021	CGGG	2	8	28690	28697	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_016021	GCC	2	6	29736	29741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_016021	TCT	2	6	29761	29766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016021	CCGT	2	8	29774	29781	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_016021	TCT	2	6	29827	29832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016021	GGC	2	6	31229	31234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016021	TGG	2	6	31280	31285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016021	CTGT	2	8	31305	31312	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_016021	TTTCT	2	10	32728	32737	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_016021	CTTC	2	8	33652	33659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_016021	GAC	2	6	33711	33716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_016021	GTAG	2	8	33722	33729	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016021	AGC	2	6	33778	33783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_016021	C	7	7	33852	33858	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
119	NC_016021	GCA	2	6	33896	33901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016021	GTC	2	6	34447	34452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016021	TGC	2	6	35915	35920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016021	CTGG	2	8	35947	35954	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_016021	CA	3	6	35968	35973	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_016021	TTCGGC	2	12	36021	36032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016021	TCA	2	6	36087	36092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016021	CGT	2	6	36100	36105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016021	CCT	2	6	36115	36120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_016021	AT	3	6	44018	44023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016021	AAAT	2	8	44045	44052	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016021	ATG	2	6	44124	44129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016021	GGC	2	6	44142	44147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016021	TGAG	2	8	44890	44897	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016021	AATC	2	8	44899	44906	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_016021	ACCTT	2	10	45719	45728	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_016021	CGCGT	2	10	45753	45762	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_016021	CTG	2	6	45821	45826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016021	GC	3	6	45877	45882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016021	CCGGG	2	10	45929	45938	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
139	NC_016021	CTC	2	6	46019	46024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_016021	CG	4	8	46030	46037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_016021	CGGGG	2	10	46098	46107	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
142	NC_016021	GGC	2	6	46147	46152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_016021	CGC	2	6	46196	46201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_016021	TC	3	6	48719	48724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_016021	CTC	2	6	48815	48820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_016021	TCC	2	6	48831	48836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_016021	CAT	2	6	48855	48860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_016021	CTT	2	6	53220	53225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_016021	A	6	6	53271	53276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016021	C	6	6	53284	53289	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
151	NC_016021	CCT	2	6	53294	53299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_016021	A	8	8	53396	53403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016021	GACG	2	8	53410	53417	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
154	NC_016021	AGA	2	6	53418	53423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_016021	AGGG	2	8	55610	55617	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
156	NC_016021	CGGC	2	8	56295	56302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
157	NC_016021	TTGCC	2	10	56328	56337	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
158	NC_016021	CGG	3	9	56345	56353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_016021	GCC	2	6	56386	56391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_016021	GA	3	6	56410	56415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
161	NC_016021	GGC	2	6	58817	58822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_016021	CGC	2	6	59115	59120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_016021	CGA	2	6	59167	59172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_016021	GCC	2	6	59217	59222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
165	NC_016021	CTCCC	2	10	59232	59241	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
166	NC_016021	CCCT	2	8	59896	59903	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
167	NC_016021	TTA	2	6	59949	59954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_016021	TA	3	6	59953	59958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_016021	ATA	2	6	59965	59970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_016021	AGGG	2	8	59971	59978	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
171	NC_016021	CA	3	6	60001	60006	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
172	NC_016021	TTCG	2	8	60067	60074	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
173	NC_016021	GCAGC	2	10	60098	60107	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
174	NC_016021	CCG	2	6	60136	60141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
175	NC_016021	CGCAG	2	10	60146	60155	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
176	NC_016021	GAT	2	6	60223	60228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_016021	G	6	6	60275	60280	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
180	NC_016021	G	6	6	60289	60294	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
181	NC_016021	CGCAG	3	15	60345	60359	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
182	NC_016021	GGC	3	9	60360	60368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_016021	A	6	6	60451	60456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_016021	CGCA	2	8	60459	60466	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
185	NC_016021	TCA	2	6	60467	60472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_016021	AAG	3	9	60493	60501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
187	NC_016021	GCA	2	6	60810	60815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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195	NC_016021	GCG	2	6	62282	62287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
196	NC_016021	ATA	2	6	62346	62351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_016021	TGCT	2	8	62381	62388	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
199	NC_016021	TCC	2	6	62927	62932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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257	NC_016021	TAC	2	6	69348	69353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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266	NC_016021	CA	3	6	71745	71750	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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274	NC_016021	CCG	2	6	73128	73133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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277	NC_016021	CTT	2	6	73213	73218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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279	NC_016021	CATT	2	8	74605	74612	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
280	NC_016021	GAGC	2	8	74613	74620	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
281	NC_016021	GCA	2	6	74677	74682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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283	NC_016021	GAC	3	9	74747	74755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_016021	ATA	2	6	74800	74805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_016021	TGT	2	6	75901	75906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_016021	TGG	2	6	75944	75949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
288	NC_016021	T	7	7	75954	75960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_016021	AAT	3	9	75977	75985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_016021	ATC	2	6	76033	76038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_016021	ACAA	2	8	76045	76052	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.